Функциональная диагностика представляет собой раздел медицины, занимающийся объективной оценкой, выявлением патологий, определением их степени в рамках исследования различных органов и систем организма. Для выполнения исследований могут быть применены инструментальные, а также лабораторные методы.

Отделение оснащено современным оборудованием, позволяющим проводить обследования детям всех возрастов, включая новорожденных. Проводятся исследования кардиологического, нейрофизиологического и пульмонологического профилей: электрокардиография, электрокардиография с функциональными  пробами, электрокардиография с дополнительными отведениями; электрокардиографическое исследование с дозированной физической нагрузкой (велоэргометрия); электрокардиографическое исследование с непрерывной суточной регистрацией электрокардиограммы в период свободной активности пациента (холтеровское мониторирование ЭКГ-ХМ ЭКГ); динамическое исследование АД при непрерывной суточной регистрации (суточное мониторирование АД - СМ АД); эхокардиография  на аппарате высокого класса PHILLIPS HD11XE (М+В режим + допплер + цветное картирование на цветном ультразвуковом аппарате с наличием сложного программного обеспечения); исследование функции внешнего дыхания с функциональными пробами (спирографияи пневмотахометрия); электроэнцефалография (ЭЭГ) с функциональными пробами; реоэнцефалография (РЭГ). 

Общее количество исследований в год по отделению составляет более 27 тысяч.